PCR實驗代測準備工作
PCR實驗代測有三步:抽提RNA,RT,PCR。
試驗前注意:
1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。
2.RT按要求做,一般不會出太大問題。
3.PCR如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單改變Mg2+濃度、退火溫度能解決的。
實驗器具的處理與準備:
1、塑料制品:(包括槍頭、EP管、勻漿管等)先將DEPC水從容量瓶中倒入瓷缸中,將塑料制品逐個浸泡其中,其中小槍頭需要吸管打入DEPC水,過夜,然后高壓,再烤干備用,實驗前將槍頭等放入吸頭臺,再高壓一次(EP管)。
2、玻璃制品:泡酸過夜,沖洗干凈,蒙錫紙烤干備用(DEPC水泡)(洗凈后先泡1‰DEPC過夜,再烤干)。
3、勻漿器:(包括剪刀、鑷子)先洗凈后,再高壓(不需要泡DEPC
試驗試劑:
1、DEPC水:吸出1ml放在1000ml雙蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中靜置4小時備用。
2、75%乙醇:用無水乙醇+DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC水需先高壓)。
3、異丙醇:放入棕色瓶中。
4、lu仿:放入棕色瓶中。
5、瓊脂糖
注意事項:
1、逆轉錄的關鍵步驟是立即冰水浴。
2、Rt時,先打開PCR預熱30分鐘。
3、RNA抽提前,打開離心機預冷。
4、在所有RNA實驗中,關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。在實驗中,一方面要嚴格控制外源性RNA酶的污染;另一方面要大限度地抑制內源性的RNA酶。RNA酶可耐受多種處理而不被滅活,如煮沸、高壓滅菌等。
5、做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。
6、RT按要求做,一般不會出太大問題。
7、PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單改變Mg2+濃度、退火溫度能解決的。
8、注意避免有毒、有害試劑傷害自己和他人:lu仿、溴化乙錠(EB)、酚、異硫氰酸胍、紫外線等